改善淺海養蚵造成的環境汙染，政府推廣使用新式環保浮具，蚵農卻不買帳，價格偏貴是主因。
廢棄蚵棚汙染海域讓台南市農業局很頭痛，近年持續和產學界合作，不斷推出ＰＵ、聚脲樹脂和改良塑膠殼包覆的新式材質浮具，都能保護保麗龍浮具，使其不易破損、減少進水增重和水中生物寄生等，正常使用可十年不壞，但成本每件約五百至八百元，是傳統保麗龍浮具的五到八倍，加上浮棚流失率高，蚵農改用新浮具意願低落。
漁港及近海管理所坦言，降低非法和遺失的蚵棚數量還有努力空間，就地焚燒棚架更要禁止，歡迎踴躍檢舉。市長賴清德多次邀ＮＧＯ團體與蚵農討論解方，市府不斷向蚵農宣導兼顧環保的社會責任，正推動申報及回收蚵架制度，保麗龍汙染已改善許多。
例如南市府自訂「淺海牡蠣養殖管理自治條例」，對未標示蚵棚的處分，從每棚一千元提高為一萬元，目前申報率達百分之九十九；未回收蚵棚者，每次處罰從一千元提高到三千元。回收保麗龍浮具每塊獎勵維持卅元，去年共回收一萬一千多塊。
但漏洞仍在，每年申報蚵架遺失也近一千棚，造成汙染持續，除了海象、固定不足等因素，養殖期過後，蚵農維修保養棚架意願降低，也是原因。
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